Fate/Grand Order（Fate/GO）

《マルタ》
長所
・アーツカードが３枚なのでＮＰを溜めやすい。当然ながらアーツチェインも組みやすいので、他のパーティメンバーのＮＰ溜めのサポートなども可能。
・宝具の威力は低めだが、バスターカードで全体攻撃かつ防御ダウン効果が付いているため使いやすい。バスターチェインに組み込めるのは当然として、最初に選ぶカードをマルタの宝具にすることで、後続の疑似的な火力増加にもなる。
・クラススキル《対魔力Ａ》と、スキル《信仰の加護Ａ》のおかげで、デバフに対して強い。
・貴重な全体回復スキル《奇蹟Ｄ》を持っている。初めは貧弱な回復量だが、きちんとスキル強化をすればそこそこの回復量になる。その上弱体化全解除のおまけつき。
・ＨＰが高い。回復系スキルを二つ所持しているため、どちらかというと耐久に優れている。ただしめちゃくちゃ固いというわけでは無いので、ジャンヌのような活躍は見込めない。

短所
・クイックカードが１枚しかないため、クラススキルの《騎乗Ａ++》がほぼ無いものになってしまっている。Ａ++と非常に高いランクだけに、とてももったいない。
・攻撃力が低い。上記の通り、宝具威力も低いため、単体だとあまり活躍できないかもしれない。強力なサーヴァントのサポート向け。


《マリー》
長所
・自身に３回無敵状態を付与する《麗しの姫君Ａ》が何と言っても強力。その上５ターンの間体力の自動回復までされるので、継戦能力が非常に高い。
・クイックカードが２枚、かつ宝具がクイックカードなので、クラススキル《騎乗Ａ+》の恩恵を受けやすい。
・宝具は全体攻撃+全体回復+弱体化全解除と使い勝手が良い。クイックカードの全体攻撃であるため、次ターンのスターの数もそれなりに期待できる。
・ＨＰが高い。上記の《麗しの姫君》、自身のＨＰ大回復のスキル《神の恩寵Ｂ》、宝具の３つが合わさって、非常に強固なサーヴァント。ただし無敵効果は自身にしか付与できず、全体回復も宝具頼みなため、パーティ全体をサポートできるジャンヌには及ばない。

短所
・アーツカードが２枚、かつＮＰ効率が悪いため、宝具を使うのに時間がかかりがち。あらかじめＮＰゲージを溜めておける礼装《カレイドスコープ》や《虚数魔術》等がないとやや使い辛いか。
・第一スキル《魅惑の美声Ｃ》が、男性に魅了付与というやや腐っているスキル。実質スキルが二つしかなく、一度霊気再臨を終わらせなければスキルなしに近い状態。


基本的にどちらも耐久・サポート型のサーヴァントであり、甲乙つけがたいです。
こうなるとほとんど好みの問題です。
マイページでのボイスや、ストーリー上での活躍などを見て、気に入ったほうを採用すればいいでしょう。

どうしても決められないのであれば、
サーヴァントの宝具をバンバン使いたいならマルタ。
相手の攻撃を耐えながらじわじわ戦いたいならマリー。
といった感じで採用するのがいいのではないかと思います。

参考になれば幸いです。
長文失礼しました。