ゲートの検問をパスしたら、左側の扉から入ります。(そっちしか開かないはず)
確か扉横のIDカードリーダーを調べるんだったかな。
内部ではうろうろできるので、ランチャーリフトの整備兵に伝えるための「伝言」を受けて、伝えてあげたり、ランチャーを動かす手伝いをたのまれたり、いろいろやればいいです。
選択肢の選び方では、正体をバラしてバトルしてしまうこともできますが、強行突破しなくても、途中までは普通に依頼をこなしていればいいと思います。
整備兵からミサイル航行データの送信をたのまれたら、そのチャンスに、ミサイルの着弾誤差を調節してしまいましょう。
誤差を最大にしてしまえば、標的にあたらなくなります。笑