マリオ＆ルイージRPG3!!!

普通なら途中の穴に落ちても、少し手前に戻されるだけで、操作不能にはなりません。
また、クッパは戦闘後エクボンの森ではなく、ヅツーダレイクに向かうと思います。
そのため、クッパを操作できるようになったら、ヅツーダレイクからのスタートだったと思います。
ただし、クッパを操作するには、マリオ&ルイージがクッパの体内に入っている必要がありますよ。

もし、それでも進めないなら、何らかのバグである確率が高いですね。

おそらく、エネルギースペースにはテレサの顔が描かれたブロックがあると思います。

まず、クッパ戦後、クッパの体内に戻ったらクッパを操作してヅツーダレイクに行きましょう。
鉄球はパンチすると、湖の中に入ることができるので、それも使って探索をしましょう。

どこかにイビッキタワーと言う建造物が湖に沈んでいる場所があったと思います。
そこでイビッキタワーとの巨大化バトルに勝つと、イビッキタワーに入れるようになります。

イビッキタワー内の奥の部屋にある本を調べると、幽霊が現れるイベントが発生するので、あとはその指示に従いましょう。

イベント発生後にエネルギースペースの進み方が分かると思います。