ポケットモンスター ダイヤモンド

たきのぼりを使う場所は、そのイベントとは、全く関係のない場所ですので、無視してください。

その場所を無視して、左に進み、どんどん奥へ行くと別の穴があります。本来のルートはそっちです。

あと捕まえ方ですが、ディアルガはこの作品の最大の目標なので、マスターボールで良いと思います。
どうしてもマスターボールは使いたくない、というようであれば、時間をじっくり掛けてディアルガをいたぶり、『タイマーボール』を使うのがオススメです。
中には並々ならぬこだわりを持ち、伝説の類は全て『モンスターボール』で捕まえる、という人もいます。余裕があれば、ぜひ挑戦してみてください。