新世紀エヴァンゲリオン2

ん〜何とも言えませんがＡＴとモードが関係していると思います。このゲームにはプレイヤーの進み方で恋愛・シリアス・学生・親子・落胆と言う５つのモードがあります。（確かこの５つだったと思う）
プレイヤーの進め方で誰かとラブラブや親子仲良くなんてモードになっちゃんですね。そこで庵野ＡＩがその時のモードによってイベント、登場人物、特殊コマンドなどを決定しているようです。
心の迷宮に行くのは、恐らくシリアスか落胆のモードに行くとコマンドとして「心の迷宮に入る」と言うコマンドがでると思われます。
シンジとアスカ、レイでこのコマンドが出ました。ＡＴは覚えてないですが確かシンジの時は回りに冷たくされてた時にでたような。アスカ、レイはネルフの秘密を探ってた時に出たような気がします。シンジはそれを選んだらおめでとうと言われＴＶエンディング？になりました。
長くなりましたがこう言うことだと思います。

ご返答ありがとうございます！

個人的にですが「尋ねる」を選ぶと、さらに選択肢が出て「心の迷宮に入る」が出ている場合があります。

「尋ねる」を選んでも毎回出る訳ではないので、すぱいらるさんの意見と同じくAT等が関係していると思います。

ちなみに私は「使徒、襲来」「アスカ、来日」「レイ、心のむこうに」「女の戦い」「最後のシ者」「アナザー・ワールド」「トウジふたたび」「VS.ゼーレ」「エンジェルバスター」「シバムラティックバランス」「人類補完計画」で「心の迷宮に入る」をやってみましたが、プレイヤーのATによって「心の迷宮に入る」を選んでからのイベントの内容が変わっているようです。

高いときほど「おめでとう」エンディングになりやすいような気がします。