ポケットモンスター リーフグリーン

外部機器とコードを使用した場合、ゲーム・データを無理やり改変するわけですから、予想外のバグが発生する危険性は０ではありません。
同じ作業をしても、すべてのソフトにバグが発生するとも限りません。
通常のプレイでは、イベント終了後に、話しかけることができないロケット団がたっていたり、ハナダの洞窟に出入りできなくなる・・・ということは発生しませんので、なんらかのバグが起きてしまったのではないかと考えます。