今から２年前（？）にエメラルドを買ったんですが、昨日あたりもう一個買ってみました ...

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質問内容

今から２年前（？）にエメラルドを買ったんですが、昨日あたりもう一個買ってみました。で、昨日買った物の記録を見ると、デオキシスやら、ホウオウなど、貴重なポケモンがたくさんいたのですが、
昨日買ったエメラルドの中にいた、デオキシスを、２年前に買った
エメラルドと交換しようとしたら、そのポケモンは今交換に出せませんと、出ました；；どうしたらデオキシスを交換できるのでしょうか？？？？

回答（3）

もう一個かったんですか＾＾；

それは図鑑が全国版になってないのが原因なので、１度殿堂入りしたらもらえます

もしそれでも通信できなかったら、改造などで無理やり出現させたポケモンだから交換できないということもあります
デオキシスやミュウを外部機器とコードを利用してゲットした場合、他のソフトに通信交換で送ろうとすると
「そのポケモンは今交換に出せません」
という文字が出て、キャンセルされる場合があります。
おそらく、最近買ったソフトをプレイしていた人が、コードでだしたデオキシスだったのではないでしょうか？

ＧＣのポケモンボックス・ルビー＆サファイア（だったかなぁ、正式の名前覚えていません）を経由すると、コードのデオキシスやミュウを別ソフトに送ることは可能ですが、もしかすると今度は、送られてきたポケモンが、ちっとも「言うことをきいてくれない」というバグが起きるかもしれません。（コード・ポケモンの場合、たとえ主人公が伝道入りしていても、言うことを聞いてくれないことがあるのです）
なおすけさんの答えが正しいと思います。

デオキシスはホウエン地方のポケモンなので全国図鑑は関係ありません。