ボーダーランズ2

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一度完了した時点（受諾した時点で報酬レベルも決定されるので、厳密には受諾した時点）でその周回では再度同じ報酬を取りなおすことはできません。
とは言え、二周目以降は装備（と敵の固さ）のインフレが激しく、次から次へ武器を取り替えていくスタイルなので、然程一つの武器に固執する必要も無いかと。
もし三周目を見据えてとか考えているなら、どうせ三周目の「てめぇらまとめてブーンだぜぇー！」を聞く頃には二周目の武器は全部交換することになってるかと思うので無理に狙う必要はありません。
強いて言うなら三周目はスラグ必須になるので、取り回しやすいスラグ武器（スラグ効果を与える必要があるだけなので威力は重視しない）はひとつ取っておいた方が良いかな。
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3週目と2.5週目は別ものですね。
1週目をクリアするとTrue Vault Hunterモード（以下TVH）というモードが解禁され、これがいわゆる2週目と呼ばれるものになります。
TVHでは攻略レベルが30?50となり1週目のキャラデータを引き継いでより高難度のゲームプレイが楽しめるのはご存知の通りかと思います。
更にこの状態でメインクエストを全てクリアすると、マップ全域の敵のレベルが50へと引き上げられより高レベルの装備が入手しやすくなります。敵キャラの強さやクエストのレベルが引き上げられるため、便宜上2.5週目と呼ばれていますが、あくまでも2週目をそのまま継続プレイしているだけなのでそれまでのクリア状況はそのままでやり込みのみが続く形となります。
この2週目のメインクエスト全クリアを達成すると、TVHを始めたときと同様にタイトル画面からUltimate Vault Hunterモード（以下UVH）というモードを新規に開始出来るようになり、これが3週目と呼ばれるモードとなります。

UVHではTVHクリア時のデータが引き継がれ、敵やクエストのレベルが常にプレイヤーレベルと同等となる可変方式が採用されており、レベル50以上（通常の最大レベルは50ですが、別途DLCであるUltimate Vault Hunterパックを導入するとレベルが最大で72まで引き上げられ、UVHに登場する敵のレベルもそれに合わせてどんどん上がっていくことになります。）のコンテンツとして楽しめます。
また、UVHではゲーム性にも変更が加えられており、敵のライフが4倍程度かつ全ての敵にライフ自動回復の能力が備わるという鬼畜仕様になっています。これに対してプレイヤー側はスラグの持続時間とスラグによる追加ダメージが強化されているため、常にスラグ状態を維持しつつの戦いというものを強いられる形となります。
このゲーム性の変化を嫌い、敢えて3週目に突入せずに遊び続けるユーザーというのも少なからず居り、そういう層に対して2.5週目の需要が多少あるかなという感じですね。

基本的に敵のレベルに合わせて武器も同等のレベルで揃えていかなければならないゲームなので、どれだけレアであろうともそれを次の段階まで持って行っても仕方ありません。
強いて言えばレベル50で止める前提で、かつ好きな武器をレベル50品で揃えたいというなら、2.5週目まで目的のサイドクエストを温存しておき、報酬レベルを50にしてからクリアするというくらいでしょうか。
2週目でも既にクリアしてしまったクエストをもう一度となると、3週目に突入するか、或いはもう一度タイトル画面からTVH（2週目）をやり直すほか無いんじゃないでしょうか。

一度完了した時点（受諾した時点で報酬レベルも決定されるので、厳密には受諾した時点）でその周回では再度同じ報酬を取りなおすことはできません。
とは言え、二周目以降は装備（と敵の固さ）のインフレが激しく、次から次へ武器を取り替えていくスタイルなので、然程一つの武器に固執する必要も無いかと。
もし三周目を見据えてとか考えているなら、どうせ三周目の「てめぇらまとめてブーンだぜぇー！」を聞く頃には二周目の武器は全部交換することになってるかと思うので無理に狙う必要はありません。
強いて言うなら三周目はスラグ必須になるので、取り回しやすいスラグ武器（スラグ効果を与える必要があるだけなので威力は重視しない）はひとつ取っておいた方が良いかな。