バイオハザード HDリマスター

ウェスカーですね。洋館事件におけるウェスカーの暗躍は彼一人の手で行われましたから。

気絶させるとしたら薬品かスタンガンを使う、もしくは延髄に衝撃を与えて脳震盪を起こして行動不能にしたか、などいくつか考えられます。これらの方法だと鍛えられた人間でも対処のしようが無いわけですから。
この時点ではまだ疑ってすらいないので、後ろから奇襲して一撃で落とせば反撃の危険も少ないのです。人を絞め落とそうとすると意外に時間がかかります。相手は訓練された特殊部隊員なので一瞬でも隙を作れば反撃される可能性があります。

クリス編でジルを拉致するのは体格差からまだ見込みがありますが、クリスを力づくで連れ去るのは難しいでしょう。何かしらの道具を使ったと考えるのが自然です。

むしろジル編（おそらく冒頭）で倒したクリスをどこに隠しておいたかが気になります。