バイオハザード5

理由は二つあります。
一つ目は作戦の目的がアーヴィングの逮捕であったことです。B.O.W.の使用が確認されていないため、6のような大規模な部隊を重装備で派遣する必要がありませんでした。
二つ目は二人がエージェント（捜査官）だということです。本来エージェントの任務は諜報や捜査に重点が置かれているので、目立つ武器を持ち歩けません。直接戦闘を行うわけではないのでそれで問題無いのです。

上記二点からクリスとシェバには目立ちにくいハンドガンが支給されました。

取引現場を押さえる予定だったアルファチームや、クリスが6で登場した際にはユニット（鎮圧部隊）の所属なので、アサルトライフルや防弾ベストで武装しています。
最初から戦闘が想定される場所に戦闘の専門担当として派遣されているためです。

最初からマシンガンやショットガンを持たされて
スタートして面白いですか？

まぁ、現実だったらハンドガン一丁でも十分な武器ですからね。

ゲームとして見るなら強い武器の方が嬉しいでしょうけど、リアルさを追求して、「そこにゾンビがいるとは思わなかった」っという設定だと思えばハンドでも不思議じゃないでしょう。

基本、戦闘があるとは限らない場所では隠し持つのにハンドガンがピッタリです。