ポケットモンスタークリスタルバージョン

たぶんでなくなりません　スイクンを倒したらスイクンはいなくなりますが・・・・・・

って言うことは、ホウオウも出なくなるってことですか？

スズのとうは、スイクンをゲットする１回だけのチャンスです。
ここで倒してしまうと、２度と挑戦できません。
したがって、スイクン・エンテイ・ライコウの３体をそろえることが不可能になりますから、ホウオウをゲットするチャンスはなくなってしまいます。

ホウオウをゲットするためには、そのゲーム内のスイクンをゲットすることが条件の１つです。
他のソフトのスイクンを通信でもらっても、ホウオウはゲットできません。