ポケットモンスター エメラルド

vgGeWQfSさん、手順として、時計が直せないカセットの中のポケモンを他のカセットに移動（修理するとデータが消える可能性があるので）したら、

『任天堂ホームページ 修理できる機種情報』のリンク
http://www.nintendo.co.jp/support/repair/syuryou.html
へアクセスし、下のほうの解説にあるように、自前に『任天堂サポートセンター』へ、電話するといいかもしれません。

自分の場合はポケモンではなくDSライトでしたが、DSライトが発売してからその日に買って1年ほど使っていて、ライト部分と画面がくらくなってきたので、任天堂サポートセンターへ電話で伝えたら、新品で未開封で届いたことがあります。
さすが、任天堂のサポート！だと思いました。
ポケモンもまだ今日見たところアドバンスのカセットは修理可能なので、完全に良い状態で送られてくる可能性は高いです。