SFCと変わっているところ（常識）

1.SFCのコースの音は、SFC版の音とDS版の音と少し違って聞こえる。

2.SFC版のハテナブロックは、地面にある。(底を踏めば使える）

3.SFC版のキャラクターのノコノコとドンキーコングジュニアが無くなっている。

4.SFC版のモグラは、敵に当たるとプレーヤーに引っ付いて動きにくくなるが、DS版はくるくる回るだけ。

5.SFC版のアイテムにジャンプができる羽があったが、DS版には無い。

6.SFC版のCPは、そのCPのキャラクター独自のアイテムを使ってくる。

マリオとルイージはスター
ピーチはミニキノコ
クッパは炎
ノコノコは甲羅
ヨッシーは卵
ドンキーコングとドンキーコングジュニアはバナナ

7.SFC版では、スピードがアップするコインがあったが無くなっている。

見つけたのはこれだけですが、まだまだありそうです。