クリア後

追加要素

クリア時に称号獲得
難易度に「THE BOSS EXTREME」追加
クリア特典アイテムの入手
・レースガン
・スーツ
・戦闘装具(グリーン・ブルー・レッド・オレンジ・タンカラー)
ノーキルクリア特典
・無限バンダナ
ノーアラートクリア特典
・ステルス迷彩
購入可能なアイテムの追加
・ステルス迷彩：５００万ＤＰ
・無限バンダナ：５００万ＤＰ
・２２口径感情弾（笑い・怒り・哀しみ・叫び）：各５０ＤＰ
・7.62ミリ口径感情弾（笑い・怒り・哀しみ・叫び）：各６０ＤＰで１０発分
・発炎筒新色（黄・赤・青・緑）：
メニューEXTRA(追加ダウンロードサービス)※クリアしてなくても最初からあります。
以下の物をダウンロード可能になります。

・iPod(R)Music
・オクトカム固定パターン
・パスワードによる隠しダウンロード


引継ぎ要素

称号
全ての装備品・アイテム・武器（Ｍｋ?U合流後使用可）
※難易度が高くなればなるほど持てる弾数が減るので、余分な弾は消えてしまいます。
iPod(R)Music
ＤＰ
ミッションブリーフィング