ストーリーモード（本編）クリア後

本編を一度クリアした後、「SP.CONTINUE」、「FREE MISSION」と「TRIAL MISSION」が出現する。 SP.CONTINUE：所持金、獲得機体、特殊兵装と新たに出現したモードを引き継ぎミッション01からプレイできる。 FREE MISSION：本編中のステージを自由に選択してプレイできる。 TRIAL MISSION：スコアやタイムアタック専用のステージ。 VS MODE：ステージが３つ追加される。 SCENE VIEWER：サイドストーリーを鑑賞できる。 MUSIC PLAYER：AC04の音楽を鑑賞できる。 OPTION には、「SCENE VIEWER」と「MUSIC PLAYER」が出現する。